游牧于巴尔喀什湖地区的厄鲁特蒙古准噶尔部异军突起，特别是噶尔丹夺得汗位后，不仅统治了厄鲁特诸部，而且征服了大山南路的“回部”各城，势力达到青海、西藏地区。噶尔丹野心勃勃，企图像当年蒙古铁骑那样再次横扫中亚各国，形成与清朝中央对峙的强大势力，并勾结沙俄，以实现其割据一方的阴谋。

　　 康熙深知沙俄对蒙古地区的野心，根据国内局势的新情况，预感到清朝与准噶尔的战争迫在眉睫，为避免两线作战，指示索额图采取灵活的外交策略，必要时可对俄国适度做出让步，以争取早日达成协议。所以当准噶尔部开始叛乱，索额图赴尼布楚谈判时，康熙指示他必要时放弃尼布楚，尽快缔结中俄条约，以收牵制俄国之效。索额图忠实执行了康熙旨意，维护了国家战略大局。

　　 当然，中俄第一次边界谈判也留下了深刻的教训：一是对沙俄的侵略本性认识不足，轻信对方承诺，以致付出极大代价。例如，清军打下雅克萨以后，托尔布津赌咒发誓不再侵略中国，可是一旦发现雅克萨清军兵力空虚，俄军立即卷土重来，迫使清军再度用兵，重新攻占雅克萨；二是保密是外交谈判成功的关键。由于担任翻译的两位白人吃里扒外，将中方谈判的某些方案暴露给了沙俄，给中方造成被动；三是外交谈判必须有战略耐心和定力，不可急于求成。清朝当时处于上升时期，综合国力在沙俄之上，且具有刚打胜仗的心理优势，中方当时本可以在上线利益上多讨价还价，但过早进入底线谈判，失去了使利益更大化的机会。

　　 总体来说，康熙制定的谈判方针是明智的，既维护了中国的核心利益，又避免了两线作战。清朝当时必须取得东北边疆的安宁，而沙俄在无力增援雅克萨的情况下，也希望通过谈判保证其在西伯利亚的利益，指示戈洛文必要时可以让出雅克萨。这样，中俄双方有了一个可以互相接受的方案，即在雅克萨和尼布楚之间划定两国边界，为协议的达成奠定了基础。

　　 《尼布楚条约》的核心内容是领土分割，它的意义不仅仅是确立了中俄两国东段边界，更主要的是以国际公法的形式肯定了外兴安岭以南包括黑龙江、松花江流域的广大地区都是中国的神圣领土，中国收复了被长期侵占的雅克萨，遏制了沙俄的进一步扩张，阻止了沙俄与噶尔丹分裂势力的勾结，使清朝得以集中力量平定准噶尔叛乱，进而统一漠北和大山地区。虽然中国也作了重大的让步，将尼布楚及其以西直至贝加尔湖原属中国的领土让给了俄国，并同意通商贸易，满足了俄罗斯一定的侵略利益，但康熙以局部利益换取了东北边疆的全局利益，随之采取了一系列经营、开发边疆的措施，使东北边疆地区的经济水平和国防实力都大大加强，保证了统一的多民族国家的进一步发展，其政治意义和国际影响都不可低估。此后150年间，中俄这段边界一直比较平静，保证了两国边境居民的安宁生活，巩固了北方边疆。